یکپارچه سازی درختان، به ویژه درختان برای تثبیت نیتروژن (NFTs)، در جنگل زراعی و سیلویو - سیستم های دامداری می تواند کمک بزرگی در جهت کشاورزی پایدار توسط بازسازی و حفظ حاصلخیزی خاک، و در مبارزه با فرسایش و بیابان زایی و همچنین ارائه سوخت باشد. مزیت خاص NFT تثبیت نیتروژن بیولوژیکی (BNF)، توانایی خاص آنها برای ایجاد نیتروژن در خاک و نیتروژن ثابت (و ماده آلی اضافی) می باشد که موفقیت آمیز می باشذ. اهمیت NFT این پرسش را به دنبال دارد که چگونه ما می توانیم به حداکثر رساندن و یا بهینه سازی اثرات BNF را مدیریت کنیم و انتقال نیتروژن به گیاهان مربوط به این موفقیت می باشد. برای اینکه قادر به دستیابی به این اهداف باشیم، ارائه روش مناسب برای اندازه گیری BNF در درختان ضروری است. روش تفاوت ازت کل (TND) ساده ترین روش می باشد، اما این روش برای نیتروژن بالای خاک مناسب می باشد. استفاده از روش استیلن کاهش (ARA) یافته، اگر چه حساس و ساده است، بسیاری از محدودیت های فنی ویژه برای NFT و برآورد BNF به طور کلی بسیار کم است، در مقایسه با روش های دیگر، برای NFT، تکنیک های نیتروژن هنوز در حال توسعه می باشد، اما در حال حاضر با توجه به برخی از نتایج امیدوار کننده خواهد بود (به عنوان مثال، اندازه گیری تنوع ژنتیکی زیادی در BNF و NFT مختلف انجام شده است). عوامل گوناگون BNF را در درختان تحت تاثیر قرار می دهند. آنها شامل سن درختان، جزء میکروبی، رطوبت خاک، دما، شوری، pH محلول، سطح N خاک و کمبود مواد مغذی گیاهی می باشند. برخی از عوامل، به عنوان مثال درجه حرارت، بر همزیستی بیشتر از رشد گیاه، و اختلاف در اثر این عوامل در BNF در ژنوتیپ های مختلف NFT تاکید دارند. این عوامل و نیازهای تحقیقاتی برای بهبود BNF در درختان مورد بحث می باشد.